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PicaGreen dsDNA 定量檢測試劑盒

更新時(shí)間:2019-04-22

簡要描述:

PicaGreen dsDNA 定量檢測試劑盒(效果同PicoGreen) *2000次*
(定量試劑是以1mL 的濃縮液形式保存在無水的DMSO(二甲基亞砜)中。實(shí)驗(yàn)當(dāng)天,配制2XPicoGreen 試劑的操作溶液,用1xTE(Component B)按1:200 的比例稀釋濃縮液。

PicaGreen dsDNA 定量檢測試劑盒(效果同PicoGreen) *2000次*

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PicaGreen dsDNA 定量檢測試劑盒(效果同PicoGreen) *2000次*試劑組成:

1.png

操作步驟:

1、試劑制備

PicaGreen dsDNA (Component A )(定量試劑是以1mL 的濃縮液形式保存在無水的DMSO(二甲基亞砜)中。實(shí)驗(yàn)當(dāng)天,配制2XPicoGreen 試劑的操作溶液,用1xTE(Component B)按1:200 的比例稀釋濃縮液。如果要準(zhǔn)備足夠的操作溶液測定20 個(gè)樣品,可在20mL1x TE (Component B)中加入100μLPicaGreen dsDNA(Component A ) 定量試劑。由于試劑容易吸附到玻璃表面,要在塑料容器中配制。PicaGreen 試劑(Component A )見光易降解,所以應(yīng)將配好的溶液用錫箔包住或放置暗處避光保存。溶液在配制好數(shù)小時(shí)內(nèi)使用,以保證較佳結(jié)果。

2、 DNA 標(biāo)準(zhǔn)曲線 

2.1 預(yù)備1μg/mLdsDNA( Component c) 或貯存液于1x TE 中。根據(jù)在1cm 光程長度的比色杯中A260nm 時(shí)的吸光度確定DNA 濃度;相應(yīng)于1μg/mLdsDNA 溶液A260=0.02。盡管任何純化的dsDNA 制劑都可用來做標(biāo)準(zhǔn)曲線,但常用的是小牛胸腺DNA。用跟被檢測的樣品相似的DNA 做標(biāo)準(zhǔn)曲線,用或長或短的線型DNA 段測定相近大小的酶切片段;質(zhì)粒用于測定質(zhì)粒DNA。然而大部分線狀dsDNA 分子,不管其片段長度大小,都會(huì)產(chǎn)生大致相等的信號(hào)。PicaGreen 試劑測定法在通常污染核酸制劑的幾種復(fù)合物存在的條件下仍能保持線狀,盡管信號(hào)強(qiáng)度可能受到影響。因此,為了得到有效的對照處理,被用來做標(biāo)準(zhǔn)曲線的dsDNA 溶液要用和實(shí)驗(yàn)樣品相同的方式來處理,并且應(yīng)該包含相同的可能存在的污染物。 

2.2 要產(chǎn)生從0.5ng/mL 到500ng/mL(見表1)單重復(fù)8 個(gè)點(diǎn)的標(biāo)準(zhǔn)曲線,在2X 終濃度下配制一系列的DNA 溶液,混合相同體積的2XDNA 和2XPicaGreen 操作溶液,放入10×10mm 比色杯中。混合相同體積的1XTE 和2XPicaGreen 操作溶液以備空白對照。避光于室溫下放置2-5 分鐘。

2XDNA 溶液濃度

(ng/mL)

2XDNA 溶液的體積

(mL)

2XPicaGreen   溶液的

體積(mL)

PicaGreen   試劑測定中DNA 的終濃度(ng/mL)

1000

1

1

500

200

1

1

100

50

1

1

25

20

1

1

10

5

1

1

2.5

2

1

1

1

1

1

1

0.5

0

1

1

空白

表1 用10×10mm 比色杯時(shí)DNA 標(biāo)準(zhǔn)曲線

2.3 當(dāng)用微量檢測皿適配器時(shí),PicaGreen 測定也可在較低的測定體積(50μL 到200μL)內(nèi)完成。欲產(chǎn)生從1ng/mL 到100ng/mL(見表2)的標(biāo)準(zhǔn)曲線,在2X 終濃度下配制一系列的DNA 溶液,混合相同體積的2XDNA 和2XPicaGreen 操作溶液,將至少50μL 溶液轉(zhuǎn)移到微量檢測皿中。確信不要在樣品中引入氣泡,輕輕地彈微量檢測皿的外部經(jīng)常可以驅(qū)散氣泡。避光于室溫下放置2-5 分鐘。

 

2X DNA 溶液濃度

(ng/mL)

2X DNA 溶液的體積

(uL)

2X PicaGreen   溶液的體積(uL)

PicaGreen   試劑測定中DNA 的終濃度(ng/mL)

200

30

30

100

50

30

30

25

20

30

30

10

5

30

30

2.5

2

30

30

1

0

30

30

空白 


表2 用微量檢測皿時(shí)DNA 標(biāo)準(zhǔn)曲線

 

2.4孵育后用合適的熒光計(jì)測量樣品熒光值。選擇藍(lán)色激發(fā)光,用熒光值大的樣品校正儀

器。

 

2.5 測量剩余樣品的熒光值。不同的微型熒光計(jì)將給出一個(gè)直接的濃度讀數(shù),數(shù)據(jù)可以用來產(chǎn)生DNA 濃度的標(biāo)準(zhǔn)曲線,下面以TBS-380 微型熒光計(jì)為例。

2.png

 圖1     PicaGreen 標(biāo)準(zhǔn)曲線

3、樣品分析

3.1 用1X TE 稀釋未知DNA 樣品至需要的體積(10×10mm 比色杯需1.0mL,微量檢測皿需25-100μL)。對樣品高度稀釋可以確保任何污染物都被大限度地沖淡。然而,也要避免取樣體積太小而無法精確吸取的情況。去除樣品中RNA 和ssDNA 參照4 部分。

3.2 在每個(gè)樣品中加入2XPicaGreen 試劑的操作溶液(3.1 節(jié)準(zhǔn)備),混合好,將混合物移入合適的比色杯,避光于室溫下放置2-5 分鐘。

3.3 可以對樣品進(jìn)行不同的稀釋處理重復(fù)測定以確保結(jié)果的準(zhǔn)確性。

 

4 去除樣品中單鏈核苷酸

當(dāng)ssDNA 與dsDNA 等摩爾濃度時(shí),后者的測定受前者的干擾很小。前者濃度10 倍于后者時(shí),。對熒光信號(hào)的干擾也不過10%。但當(dāng)DNA 濃度低時(shí),ssDNA 能產(chǎn)生較大干擾在高濃度時(shí),由RNA 結(jié)合PicaGreen 試劑產(chǎn)生的熒光值用RNA酶處理樣品可消除。RNA 酶A、酶T1 結(jié)合核酸酶S1 能除去所有單鏈核酸,從而保證樣品熒光值是由dsDNA 產(chǎn)生。(具體做法請查閱相關(guān)的參考文獻(xiàn))

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